報告題目1:一個高效、準確、穩(wěn)定的基因組預測算法
報告人:劉小磊 教授
報告時間:2021年6月24日(周四)上午9:30—11:00
報告地點:生命科學學院412會議室
報告內(nèi)容簡介:
高計算效率的方法預測準確性較低,高預測準確性的方法計算效率較低,一個準確性高且計算高效的基因組預測算法KMAL被開發(fā)出來以解決這一難題。該方法利用機器學習的策略解析基因組和表型組大數(shù)據(jù)之間的隱藏關(guān)系,并根據(jù)表型的遺傳復雜程度智能化選擇最優(yōu)預測模型來提高基因組預測的準確性。KAML能夠有效的助力動植物基因組育種產(chǎn)業(yè)以及疾病風險預測等人類大健康產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
報告人簡介:
劉小磊,博士,華中農(nóng)業(yè)大學動物遺傳育種系教授、博士生導師,院長助理。研究方向為統(tǒng)計遺傳學,致力于全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)和基因組選擇/預測(GS/GP)算法的研究,開發(fā)的FarmCPU、KAML等算法以及rMVP、HIBLUP等軟件包被廣泛應用于人類及動植物復雜性狀解析和預測,相關(guān)研究成果發(fā)表于Genome Biology、PLoS Genetics、Genomics Proteomics & Bioinformatics、Bioinformatics、Communications Biology等行業(yè)主流期刊,其中FarmCPU算法文章被引400余次。主持國家自然科學基金青年基金、面上項目、重點項目子課題、國家重點研發(fā)計劃子課題等。入選中組部青年拔尖人才計劃(2020),湖北省青年科技晨光計劃(2017),獲國家技術(shù)發(fā)明二等獎1項(6/6)、教育部科技進步一等獎1項(4/13);發(fā)表SCI論文20余篇,授權(quán)發(fā)明專利5件,軟件著作權(quán)6件。
報告題目2:基于豬整合組學知識庫和卷積神經(jīng)網(wǎng)絡模型的基因評分方法
報告人:付玉華 博士
報告時間:2021年6月24日(周四)上午11:00—12:00
報告地點:生命科學學院412會議室
報告內(nèi)容簡介:
利用基因組和表型組信息,采用基因組選擇策略進行候選基因定位和個體育種價值評估已成為當前遺傳學和育種學大數(shù)據(jù)分析的主流方法。然而基于單一基因組學分析的結(jié)果往往止步于基因和表型的“相關(guān)”層面,難以揭示兩者間的“因果”關(guān)系。如今,生物多組學大數(shù)據(jù)為基因的調(diào)控機理和功能解讀帶來了曙光,但如何在統(tǒng)計模型中有效整合海量的多組學信息面臨著巨大的挑戰(zhàn)。報告人構(gòu)建了國際上首個豬整合組學知識庫ISwine,嘗試利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡等深度學習策略,整合利用豬基因組、轉(zhuǎn)錄組、調(diào)控組、文獻組等組學信息特征,挖掘組學大數(shù)據(jù)與表型間的隱藏關(guān)系,為豬重要經(jīng)濟性狀的候選基因挖掘提供了新思路,并為豬的智慧育種提供了新工具。
報告人簡介:
付玉華,男,博士,助理研究員,研究方向為生物信息與動物遺傳育種,致力于多組學數(shù)據(jù)的整合與挖掘,構(gòu)建了國際上首個豬整合組學知識庫ISwine,相關(guān)成果發(fā)表在Communications Biology、Bioinformatics、DNA Research、Animal Genetics等雜志。主持國家自然科學基金青年基金1項,中國博士后科學基金2項,中央高校創(chuàng)新基金2項。取得授權(quán)發(fā)明專利1項,獲批軟件著作權(quán)7項,其中有5項為第一完成人且完成了科技成果轉(zhuǎn)化240萬。以一作/共一發(fā)表SCI科研論文8篇,以共同作者發(fā)表SCI科研論文24篇。
歡迎廣大師生參加!