報(bào)告題目： 空間組學(xué)Stereoseq介紹及細(xì)胞注釋
報(bào) 告 人： 劉林研究員
報(bào)告時(shí)間：2024年4月28日(周日)上午：9:00-11:00
報(bào)告地點(diǎn)： 綜合實(shí)驗(yàn)樓4樓會(huì)議室
報(bào)告摘要： 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能為正常、發(fā)育和病變細(xì)胞、組織、器官、疾病提供基因表達(dá)圖譜，促進(jìn)新型細(xì)胞類別的鑒定，改進(jìn)我們對(duì)正常和疾病相關(guān)的生理過(guò)程的理解，并促進(jìn)新治療方法的開(kāi)發(fā)。那么，時(shí)空組學(xué)技術(shù)突破，則可幫助我們了解細(xì)胞命運(yùn)復(fù)雜調(diào)控過(guò)程。時(shí)空組學(xué)全面應(yīng)用于器官結(jié)構(gòu)、生命發(fā)育、生命演化、人類疾病等重大問(wèn)題研究，將推動(dòng)生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展。Stereo-seq技術(shù)將推動(dòng)生命科學(xué)研究進(jìn)入到時(shí)空時(shí)代。但是，新的生物技術(shù)對(duì)于新的生物信息算法與工具提出了新的挑戰(zhàn)，基于此，課題組提出了針對(duì)空間轉(zhuǎn)錄組的細(xì)胞注釋算法與工具spatial-ID。
報(bào)告人簡(jiǎn)介：劉林，深圳華大生命科學(xué)研究院，生物智能技術(shù)研究所，生物信息研究員，深圳市高層次人才(海外)，鹽田區(qū)梧桐人才。主導(dǎo)開(kāi)發(fā)多個(gè)生物信息相關(guān)原創(chuàng)分析方P法，包括整合代謝網(wǎng)絡(luò)和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的建模框架r-deFBA,空間組學(xué)細(xì)胞類型注釋方法Spatial-ID及多數(shù)據(jù)整合算法spatialign等。主要研究工作發(fā)表在Nature Communications (IF=16.6), Journal of Integrative Plant Biology (IF=11.4), GigaScience (IF=9.2)等國(guó)際期刊上，授權(quán)國(guó)際專利4項(xiàng)。研究方向?yàn)樯镄畔⒏呒?jí)分析算法和工具研發(fā)，包括DNA序列AI大模型、單細(xì)胞/空間多組學(xué)、多模態(tài)數(shù)據(jù)挖掘及整合算法和工具研究。
歡迎廣大師生參加！
